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注释与参考文献是学术论文必不可少的组成部分，也是学术论文写作中的规范要求之一。但是，在日常的论文写作中，有些作者往往把二者相混淆。例如有的不加区分地将它们混在一起；有的虽然有区分，但区分不正确；有的图省事，干脆只列一种代替另一种，等等。注释和参考文献无论在功能上还是在著录格式上，都有明显区别。 一、性质和功能上的不同。注释的功能主要有四个方面：一是解释题目或说明论文的写作缘起，及背景情况；二是说明引文资料的来源和出处；三是对正文表述不完善而又不便于在正文中作进一步说明的内容加以补充、解释和说明；四是对正文中艰深、生僻的内容或词句给予必要的解释或说明。而参考文献则是在论文的写作时，对所参考的文献的深度与广度的标示。因此，二者在性质和功能上是有明显区别的。二、著录形式上的不同。注释(文末注除外)一般列于篇首页地脚处，不加序号；而参考文献(夹注除外)则多采用文末注，并且按文献的重要程度或先后顺序编排序号。引文出处注释(除篇名注、作者注、收稿日期注之外)一般是对某一论点、某一资料所作的征引，必须注明资料的准确来源和出处；而参考文献则是对某一论文从整体上的参考或借鉴，一般无须注明章节、页码等具体出处。另外，引文出处注释根据论文写作的需要，可对一份文献多次引用并多次注明，而参考文献则只需在文末作一次性注明即可。 
毕业论文使用的是尾注，尾注和参考文献的区别在于所属领域不同：尾注是属于格式上的划分，参考文献是论文内容上的划分。本科论文格式要看每个学校的具体要求。一般来说脚注尾注都能用到。论文注释按照注释放置的位置可以分为当页脚注和参考文献。当页页下的脚注就是在该页面对本页文中引用的文献资料进行注释，而参考文献就是把所有的参考文献放在论文的最末尾，单独作为一个部分。参考文献是用尾注的。参考文献是引用人家已发表的观点或者文章或者实验结果等，需要在引用的那段话后面加[1][2]这样的上标，然后文章末尾列“参考文献”时与文中的上标相对应。
据学术堂了解，论文的参考文献引用的是别人的论文观点和成果，而脚注更多是自己对于这个名词或者概念的详细说明，用于向对于此类课题还不了解的人进行解释。不同之处在于参考文献引用肯定是别人论文的成果或者内容，无非是直接或者间接的，脚注更多的是作者自己的解释。
脚注尾注参考文献三者的区别是：1、文本不同：脚注或尾注由两个互相链接的部分组成，注释引用标记和与其对应的注释文本，在注释中能够使用任意长度的文本，并像处理任意其他文本一样设置注释文本格式。参考文献是来说明正文内容的来源。2、位置不同：脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释。而尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目，集中列表于文末。3、适用不同：脚注是解释正文中某一个词和句，不便于在正文中解释，怕影响正文的连续性，而在页脚上面插入解释。是引用的一种，只出此刻当页，而不会出此刻此节的每一页。尾注与题注的形式差不多，一般用于这句话或者段落了，出自何处。在全文尾部给予说明，与正文资料相差很远，参考文献是论文内容上的划分。Word脚注设置技巧默认情况下，Word用一条细实线把脚注和尾注与文档的正文分隔开来。要修改这条分隔线并不困难，关键在于要知道在哪里修改。选择菜单“视图”→“普通”，确保文档以“普通”视图显示，然后选择“视图”→“脚注”打开脚注窗格。如果文档只包含脚注或只包含尾注，Word自动打开适当的窗格；如果文档既有脚注又有尾注，Word将询问要打开哪个窗格，选择适当的窗格然后点击“确定”。
参考文献是引用人家已发表的观点或者文章或者实验结果等，需要在引用的那段话后面加[1][2]这样的上标，然后文章末尾列“参考文献”时与文中的上标相对应。脚注一般在文章第一页，在正文部分的左下侧，是写作者的个人信息，例如作者，哪里人等信息或通讯作者的信息，这篇发表的这篇文章是哪个项目或者基金的组成部分。你可以下载一篇已发表的文章进行对照比较，就很容易懂了！
