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这个没有办法比较，需要给出具体的会议及期刊名，比如：你在世界级的www会议上发表一篇English论文A 一般计算机期刊上发表English论文B当然A > B 当然对你所说的，国内对EI收录相当看重，所以我想最好在核实核心期刊以及会议那个会被EI收录。 
您这个问题比较笼统，不同硕士或者不同期刊论文，其创新、分量和含金量有天壤之别硕士得看什么学校、什么学科的硕士；如果该专业有国家一级重点学科，这种学校的硕士论文一般还是不错的；期刊也得看什么样的期刊，分省级、国家级、还有像SCI、CELL等这类国际顶级期刊最好把您的问题具体化，这样大家才能比较准备的回答您的提问
很难说哪个更权威，但在国际上，说权威当然是比较好的期刊论文
