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1、化学肥料对土壤理化性质的影响 长期使用化学肥料对土壤酸度有较大影响。过磷酸钙、硫酸铵、氯化铵、氯化钾等属于生理酸性肥料，即植物吸收肥料中养分离子后土壤中 H+增多。化学肥料也可促使某些营养元素的固定，使之转化为植物不能利用的形态，如单方面大量施用磷肥，可促使土壤中活性锌含量显著降低，造成植物的锌缺乏。 2、化学肥料引起的土壤重金属污染 氮、钾肥料中重金属含量较低，而磷肥中含有较多的有害重金属。原因是磷肥的生产原料是磷矿石，其中含有一定量的重金属。多数磷矿石含镉5～100mg/kg，大部分或全部进入肥料中。由于镉在土壤中运动性较小，淋失很少，也不会被微生物分解，可在土壤中不断积累而危害生态环境和人类。不同种类的肥料其重金属含量也不相同，一般过磷酸盐中重金属含量较高，其它磷肥次之 3、化学肥料引起的土壤辐射性污染 由于化肥原料中携带放射性元素，化肥的使用将放射性扩散到农田土壤中，经过食物链，最终被人体摄取。经常使用磷肥和钾肥会将放射性物质扩散到农田环境并不断积累。它们通过肥料→土壤→农作物→动物或经过食物链，最终被人体摄取而产生危害。 因此，我建议应合理施用化肥，采用有机肥与无机肥配施的方法来保护土壤，增加产量。 
随着化肥农药等化学合成物质作用于农业生产中可以使农业生产能力得到极大提高增加农产品产量给农民带来更多收入，然而过度使用化肥农药不仅会引发食品安全问题土地也会受到不同程度污染。农药化肥等不合理使用导致农业耕地污染不断加剧，我国农业的化肥和农药使用量占全球总量30%以上，并且利用率过低造成土地土壤酸化盐化和板结导致地力下降，重金属硝酸盐等有害物质污染土壤甚至是水和空气，最后破坏了生态环境同时也会导致农产品质量下降。合理使用化肥农药是对土壤没有破坏的，但是滥用化肥农药肯定会对土壤造成一定的破坏。比如长期大量使用化肥会造成土壤板结还会加快土壤盐碱化，长期大量使用农药对土壤的破坏更加严重，农药残留会长期对土壤产生污染，肥料分有机肥和化肥两种，土壤里氮磷钾的成本是植物生长的条件，如果完全使用化学肥料土壤有机质必然得不到补充导致土壤板结，再就是化肥里有各种重金属成份如果土壤缺少有机肥分解重金属，会使农作物果实吸附这些有害的重金属，人食用重金属超标的农产品对身体伤害很大尤其是镉砷铅这几种致癌的重金属。
