江南好
论文查重各学校要求不一样，有的是论文全部都查，有的不查封面、声明、授权、目录、注释、参考文献。论文审核不通过原因有很多，论文查重率高、文章写作上存在明显问题或错误（格式、结构、逻辑、语言有问题）、文章没创新、论文主题与投刊物不匹配等。 
论文查重的是整篇论文不止是论文的正文。论文审核不通过的原因有很多种，比如你的查重重复率太高，写的论文正文与标题关系不大等等
论文查重，是查全文的，不是只查正文。论文审核不通过的原因很多，查重只是最基本的。比如你的文章内容可能与刊物不符合，或者是文章质量达不到刊物要求。还有可能是文章内容不适合发表等。
研究生论文定稿没通过还有补救需要将论文定稿拿回来重新进行修改后再次提交审核论文没通过的原因：1、论文质量不过关；2、论文重复率过高；3、在答辩时，答辩老师认为你的论文有些小问题，或者你的答辩表现不好，导致论文不通过。应该按照以下办法进行处理：1、选题要独具创新性；2、语言要通俗易懂；3、图片要足够精美；4、文献引用要有技巧
