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据学术堂了解，发表医学论文可以分为基础医学论文和临床医学论文。 (一)基础医学论文 研究人体的解剖和生理功能、致病因素以及人体对致病因素的入侵和药物或其他治疗措施的干预所做出的反应，认识健康和疾病相互转化的规律成为基础医学。基础医学论文多数属于基础理论研究范围，包括实验研究和现场调查，少数属于技术交流范围，即介绍实验技术，有关仪器的设计、制造及使用等。 (二)临床医学论文 临床医学是研究人体各系统疾病发生的机制、诊断和治疗，促进疾病向健康转化以及其中的学科。临床医学论文多为应用研究范围，可分为诊断、治疗、护理等方面，有理论研究和技术报告，目前属回顾性总结分析的论文较多。 不管是基础医学还是临床医学，在撰写的过程中，我们都要注意，面对病患的信息，我们都要以保护患者信息为主，不可轻易泄露患者的私人信息。 
医学论文的级别分为核心期刊和普刊。其中普刊分为省级和国家级，核心期刊分为科技核心和北大中文核心期刊。主要看您评什么级别的职称和单位要求发表的级别来选择期刊了。。。
严格上说国内有6个称为核心期刊的体系：1、北京大学图书馆（中文核心期刊）；2、南京大学（中文社会科学引文索引（CSSCI）来源期刊）；3、中国科学技术信息研究所（中国科技论文统计源期刊）（又称中国科技核心期刊）；4、中国社会科学院文献信息中心（中国人文社会科学核心期刊）；5、中国科学院文献情报中心（中国科学引文数据库（CSCD）来源期刊）；6、中国人文社会科学学报学会（中国人文社科学报核心期刊） 。国外目前SCI：(Science Citation Index)是由美国科学信息研究所(ISI)1961年创办出版的引文数据库。EI也是美国的综合性检索工具，是科技界共同认可的重要检索工具。通常优助医学把论文级别的分类（一般单位或者科教处也如此分类）SCI/中文核心/科技核心/普刊
