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不算，若用户引用参考文献的格式设置正确，查重系统不会计算参考文献的重复率，而是计算参考文献的引用率是多少。查重系统在对参考文献查重时，会先识别参考文献的引用格式，若格式正确，查重系统会将参考文献的内容和引用库的内容进行比对，如果内容一致，查重系统就会判断这部分内容为参考文献部分。在写论文过程中引证文献是在正常不过的事情了，在写作之前要阅览很多的文献，了解行业界学科发展的状况，这本身也是常识积累和学习的一个过程，因此，只要作者在写论文的时候，用正确的引用格式，且引用的部分不是很大就不会有影响，知网论文查重会自动识别为引用部分，以绿色字体标注。但是一定要注意的是，引用过程中绝对不能大片的引用，因为也会被检测为抄袭。 
论文参考文献怎么合理引用才能通过查重？ 本文详细的分析了一些在引用文献时的注意事项
一、合理运用引号在上交论文的时候，如果想要自己的引用内容顺利通过论文检测，就需要使用引号来标记大部分引证内容，这样格式才是合理的。如果没有使用引号，并且与对比数据库中的内容相似，很有可能会被判定为重复。所以在做引证的时候，一定要记得把引号用上。引号要完整，只有一半的时候，论文查重是认不出来的，到时候也会判定大部分是抄袭的。二、到底是不是引证在论文查重时，有些引证类似会被判定为抄袭，所以关于引证的通常，要先看论文查重系统中是否涵盖了这篇文献，如果没有收录这篇文章，那么这种引证通常不太会被判定为抄袭，也有可能被判定为抄袭，所以在使用这些通常情况下，需要保证文献库中也涵盖了这篇论文。三、引证占有率过大有些人为了避免被论文查重检测到，会大幅度的引证某篇论文中的内容，没有添加引号查重不到，同样也会被检测到，但是论文查重在规划的时候就把这一点考虑进去了，所以过大的引证份额也会被判定为抄袭。在写论文的过程中不要过度引用，否则必然会被检测出影响最终重复率。
标准的查重报告中，你引用的内容和参考文献标注序号相对应的情况下，会单独列出，但也算重复率。完全不重复的话，只能用自己的语言将原意表达出来，但是有些定论和讲话之类的，又不能过于改变，所以只能是尽量少引用。
