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摘要 世纪70年代诞生的基因工程、克隆技术和干细胞研究等现代生物技术, 使生命科学的发展进入了一个新阶段, 这些以创造或改变生物类型及生物机能为目标的现代生物技术已成为新技术革命的三大支柱之一。通过探寻生命本质及生长发育、疾病、衰老等奥秘, 揭示生命现象的内在规律。随着生物技术在医药、食品化工、农业、环保以及能源、采矿等工业部门中的广泛应用, 它正在对人类经济及社会生活和社会进步产生深刻而广泛的影响。关键字:生命科学 生物技术 人类生活 影响随着生物科学的发展,生物科学技术对人类社会的影响越来越大。这主要表现在以下几个方面: 影响人们的思想观念,如进化的思想和生态学思想正在被越来越多的人所接受。 促进社会生产力的提高,如生物技术产业正在形成一个新兴产业;农业生产力因生物科学技术的应用而显著提高。 随着生物科学的发展,将会有越来越多的人从事与生物学有关的职业。 促进人们提高健康水平和生活质量,延长寿命。 影响人们的思维方式,如生态学的发展促进人们的整体性思维;随着脑科学的发展,生物科学技术将有助于改进人类的思维。 对人类社会的伦理道德体系产生冲击,如试管婴儿、器官移植、人基因的人工改造等,都会对人类社会现有的伦理道德体系产生挑战。 生物科学技术的发展对社会和自然界也可能产生负面影响,如转基因生物的大量生产改造物种的天然基因库,可能会影响生物圈的稳定性。 理解科学技术与社会的关系,是科学素质的重要组成部分。一、生物与基因科技 生物与基因科技的进展,已促使生物医学的研究迈入后基因体医学时代,这些尖端医疗科技在提升人们健康福祉的同时,也给家庭和社群等各个层面前带来所未有的影响。其中有些影响或许还是潜在的。 (1)基因改造作物(genetic modified organism) 科学家以基因改造的方式改良农作物,以促进收成、防治病虫害、提高经济效益,希望可以解决人类粮食不足或营养问题,但是基因改造作物会不会创造出新的过敏原、对人体造成新的健康问题、引起昆虫的抗药性、制造所谓的基因污染?基因改造作物所带来对自然与人类社会的风险、安全性与效益如何评估?基因改造作物的专利权将如何规范?其巨大商业利益是否将加剧资本家对弱势族群、第三世界国家的经济控制或剥削?究竟,人与植物、自然生态的理想关系应该如何?(2)基因检测(Genetic testing): 基因检测有助于遗传疾病的诊断、预防及处置,执行的时机常见于婚前健康检查、胚胎植入前检测、产前检查、新生儿筛检、儿童及成人的遗传检验等,检测的性质又可分诊断检测、带原者检测、发病前检测、罹病倾向检测。由于遗传信息不仅关乎个人,同时也与家庭或家族其他成员的健康息息相关,因此遗传信息的获得与告知时常带来特殊的医学伦理问题,包括:基因信息带来的心理负担及社会压力,基因诊断结果的告知对个人与家庭、家族的影响,个人隐私的保障与家庭成员利益产生冲突,基因检测引起的医疗资源分配、社会正义议题等。 (3)基因治疗(gene therapy): 科学家透过基因治疗希望能为人类目前各种主要的死亡原因、慢性疾病、遗传疾病的治疗带来曙光,一般分为体细胞基因治疗及生殖细胞基因治疗。体细胞基因治疗乃针对已发病或将发病患者的体细胞,在基因的层次作医疗介入,以病毒为载体、或使用物理方式将好的基因传送到欲治疗的体细胞或组织,以取代或修补有缺陷的基因,并发挥正常生理功能。体细胞基因治疗的相关伦理议题与一般新进医学科技、临床试验所必须考量的内涵大致相同。其中,应采取何种程序方能公平选出接受治疗的病患?应采用何种步骤以确保患者或其父母或监护人的知情同意?生殖细胞基因治疗则是对生殖细胞或胚胎进行基因调控,以期根绝病因、一劳永逸,然而对生殖细胞直接进行基因介入却可能改变新生儿的遗传组合、造成长远的医源性的伤害,同时可能引起设计家宝宝、基因超市、出卖基因以牟利、政变人种等发展的疑虑。这些问题正在或即将对人类的家庭、社会伦理观念与道德实践带来重大的冲击,理应纳入到生命伦理学的思考范围之内。 
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1 绪论2 算法与复杂性1 算法是什么?2 生物学算法与计算机算法3 找钱问题4 正确的与错误的算法5 递归算法6 迭代算法与递归算法的比较7 快速算法与慢速算法的比较8 大O记号9 算法设计技术10 易处理与不易处理问题的比较11 附注人物天地:Richard K12 问题3 分子生物学简介1 生命是由什么组成的?2 什么是遗传物质?3 基因是干什么的?4 哪些分子编码基因?5 DNA的结构是怎样的?6 在DNA和蛋白质间传递信息的物质是什么?7 蛋白质是由什么组成的?8 我们该如何去分析DNA?9 一个物种的个体差异是怎样产生的?10 不同物种间有怎样的差异?11 为什么要搞生物信息学?人物天地:Russell FDoolittle4 穷举搜索1 限制酶切作图2 不实用的限制酶切作图算法3 一个实用的限制酶切作图算法4 DNA序列上的调控基序5 序列剖面6 基序发现问题7 检索树8 发现基序9 发现一个中间字符串10 附注人物天地:Gary S11 问题5 贪婪算法1 基因组重排2 反序排序法3 近似算法4 断点:贪婪的另一面5 贪婪方法与基序发现6 附注人物天地:David S7 问题6 动态规划算法1 DNA序列比较的力量2 找钱问题重述3 曼哈顿游客问题4 编辑距离与联配5 最长共同子序列6 全局序列联配7 得分联配8 局部序列联配9 缺口罚分联配10 多重联配11 基因预测12 基因预测的统计方法13 基于相似性的基因预测方法14 剪接联配15 附注人物天地:Michael W1 6 问题7 分而治之算法1 排序问题的分治法2 空间效率高的序列联配3 模序联配和四个俄罗斯人的加速法4 在亚二次时间内构建联配5 附注人物天地:Webb M6 问题8 图算法1 图2 图与遗传学3 DNA测序4 最短超字符串问题5 作为可选择测序技术的DNA阵列6 杂交测序7 SBH与Hamilton路问题8 SBH与欧拉路问题9 DNA测序中的片段装配10 蛋白质测序和鉴定11 肽测序问题12 谱图13 基于数据库搜索的蛋白质鉴定14 谱的卷积15 谱联配16 附注17 问题9 组合模式匹配1 重复序列发现2 哈希表3 精确模式匹配4 关键词树5 后缀树6 启发式相似性搜索算法7 近似模式匹配8 BLAST:依靠数据库的序列比较9 附注人物天地:Gene M10 问题10 聚类和树1 基因表达分析2 系统聚类3 k-均值聚类4 聚类和有瑕团5 进化树6 基于距离的树重构7 由可加矩阵重构树8 进化树与系统聚类9 基于字符的树重构10 小简约问题11 大简约问题12 附注人物天地:Ron S13 问题11 隐马氏模型1 CG岛和“公平赌场”2 公平赌场和隐马氏模型3 解码算法4 隐马氏模型参数估计5 剖面隐马氏模型联配6 附注人物天地:David H7 问题12 随机化算法1 排序问题回顾2 吉布斯抽样3 随机投影4 附注5 问题参考文献索引