我的琪琪
学友你好：毕业论文不放在个人人事档案，由考办负责存放保管。具体如下： 在办理完毕业手续领取毕业证书的同时，还会拿到毕业证书及学籍档案材料原件含自考毕业生登记表、审定表，半年后获得学士学位的考生还会有一份学位审定表，一定要将这些档案材料存放到档案管理部门。 没有正式工作单位的，可存放到户籍所在地的人才交流中心或城镇街道办事处或农村的村民委员会，然后复印一份档案并加盖上述单位公章，切忌自己保管档案材料。 
本科毕业论文只要查重能过，你答辩的时候稳定发挥，一般老师不会太卡你的。这个肯定是会放进档案袋里面的。
每个学校的规定不一样，多数学校比较重视，而且会存档
