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知识产权归属根据《中华人民共和国著作权法》第十一条规定，著作权属于作者，本法另有规定的除外。创作作品的公民是作者。由法人或者其他组织主持，代表法人或者其他组织意志创作，并由法人或者其他组织承担责任的作品，法人或者其他组织视为作者。如无相反证明，在作品上署名的公民、法人或者其他组织为作者。第十二条，改编、翻译、注释、整理已有作品而产生的作品，其著作权由改编、翻译、注释、整理人享有，但行使著作权时不得侵犯原作品的著作权。《民典法》第六百条的规定如下：出卖具有知识产权的标的物的，除法律另有规定或者当事人另有约定外，该标的物的知识产权不属于买受人。《著作权法》第二十条规定：作品原件所有权的转移，不改变作品著作权的归属，但美术、摄影作品原件的展览权由原件所有人享有。 
硕士学位论文的知识产权归作者本人所有，你们学校的规定根本就不对。你可以通过授权的方式允许学校使用、保存，但权利是自己的，你所在的学校和你的导师根本无权决定，更不能以此相要挟不给学位证。你可以到有关教育主管部门反映情况，通过上级机关解决，实在不行就只好去法院了。好奇问一句，你在哪个学校？怎么这么不讲理！
论文第二单位没有文章所有权。论文中可能涉及的知识产权应该是有很多种，专利权、著作权、商业秘密等等都有可能涉及，但最重要的还是著作权。著作权的权属规定如下：著作权法第九条规定，作品的著作权人有两类：一是作者;二是其他依法享有著作权的公民、法人或者其他组织。实践中，按照作品的权利主体情况来划分，作品可以分为个人作品、职务作品和法人作品，而职务作品实质上是个人作品的一种。 (一)个人作品 所谓个人作品，就是权利完全归属于作者个人的作品。《著作权法》第十一条规定，创作作品的公民是作者。作品的著作权属于作者。 (二)职务作品 关于职务作品，《著作权法》第十六条规定的很明确： 第十六条 公民为完成法人或者其他组织工作任务所创作的作品是职务作品，除本条第二款的规定以外，著作权由作者享有，但法人或者其他组织有权在其业务范围内优先使用。作品完成两年内，未经单位同意，作者不得许可第三人以与单位使用的相同方式使用该作品。 有下列情形之一的职务作品，作者享有署名权，著作权的其他权利由法人或者其他组织享有，法人或者其他组织可以给予作者奖励： (一)主要是利用法人或者其他组织的物质技术条件创作，并由法人或者其他组织承担责任的工程设计图、产品设计图、地图、计算机软件等职务作品; (二)法律、行政法规规定或者合同约定著作权由法人或者其他组织享有的职务作品。 分析上述条文可知： 1、一般情况下，职务作品的著作权属于作者，但其著作权有所限制：(1)单位有权在其业务范围内优先使用;(2)作品完成两年内，未经单位同意，作者不得许可第三人以与单位使用的相同方式使用该作品。 2、在两种情况下，职务作品的著作权则分别由(1)作者享有署名权、获得奖励权(2)单位享有其他著作权权利。 (三)法人作品 所谓法人作品，《著作权法》第十一条第三款规定，由法人或者其他组织主持，代表法人或者其他组织意志创作，并由法人或者其他组织承担责任的作品，法人或者其他组织视为作者。 (四)合作作品 《著作权法》第十三条 两人以上合作创作的作品，著作权由合作作者共同享有。没有参加创作的人，不能成为合作作者。 合作作品可以分割使用的，作者对各自创作的部分可以单独享有著作权，但行使著作权时不得侵犯合作作品整体的著作权。 (五)委托作品 《著作权法》第十七条 受委托创作的作品，著作权的归属由委托人和受托人通过合同约定。合同未作明确约定或者没有订立合同的，著作权属于受托人。
1、关于SCI论文的法定负责人也即你所说的版权的负责人。一般情况下， SCI论文的通讯作者对这篇论文负有责任，包括学术责任和法律责任。因而，通讯作者也是论文的主要受益人之一。也可以这么说，论文的第一作者是这项科研成果的主要贡献者。2、而论文的通讯作者是这项成果的责任者和受益人。在这种情况下，要是这项研究成果涉及到专利，那么这个专利是属于通讯作者或者单位。因为，通讯作者一般指整个课题的负责人，承担课题的经费，设计，文章的书写等。他也是文章和研究材料的联系人。最重要的是，他担负着文章可靠性的责任。3、第一作者一般是本文工作中贡献最大的研究人员。此作者不仅有最多和最重要的图表(即体力上的贡献)，也是文章初稿的撰写人(即对本文的智力贡献)。
一般情况下，导师放到最后是通讯作者，就是关于这篇论文的有关情况你可以直接跟这个老师联系。第一作者是主要完成论文的
国内有实际作用的就是： 一作、二作、通信作者。这里面存在组合情况！ 国内实验组发的论文，习惯把一些老师挂在最后，不管实际做出的贡献。中国特色！985高校博士，已发数篇SCI期刊论文，通信方向！
很多SCI的惯例是研究生第一作者需要导师在后面署名罩着很多时候paper是accepted了但打回来的修改意见是：请增署阁下导师的姓名
