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深度不同。本科毕业论文可以提出新的理论观点，可以从自己的角度去解释已有的理论，甚至可以只是一份对于某观点的调查报告；而研究生毕业论文必须有新的内容，例如提出新理论，针对已有理论提出新观点、新解释、新论据等等，论点可大可小，但论据要充分、论证要严密、例证要确凿、计算要准确、图表要严谨，全文必须有新意，绝不可抄袭、雷同、人云亦云，一定要跳出窠臼，有所创新。硕士学位论文只能有一个主题(不能是几块工作拼凑在一起)，这个主题要具体到问题的基层(即此问题基本再也无法向更低的层次细分为子问题)，而不是问题所属的领域，更不是问题所在的学科，换言之，研究的主题切忌过大。因为涉及的问题范围太广，很难在一本硕士学位论文中完全研究透彻。通常，硕士学位论文应针对某学科领域中的一个具体问题展开深入的研究，并得出有价值的研究结论。硕士学位论文是学术作品，因此其表述要严谨简明，重点突出，专业常识应简写或不写，做到层次分明、数据可靠、文字凝练、说明透彻、推理严谨、立论正确，避免使用文学性质的或带感情色彩的非学术性语言。论文中如出现一个非通用性的新名词、新术语或新概念，需随即解释清楚。 
两者不一样！从字数上、学术观点上、文献引用上等等不一样，差多了！从字数上说，本科要求在6000-8000，硕士一般在3万-4万，差的学校2万-3万；这是正文字数的要求，不包括导言，引用、文献等！本科的学术观点基本上是没有多大新意，可看成是报告！而硕士就不一样了，要求在自己的研究领域有自己的创新观点，能够领会该领域的最新成果；在文献引用上本科没有多少的硬性要求，而硕士论文文献分为一级文献、二级文献等，所谓一级文献简单滴说就是和论文关系比较密切的文献，二级稍微一些！此外，还分为原始文献、外国文献等，作为硕士论文一般来讲应该引用到外国的最新研究成果！并且在硕士论文的开篇后应该有个文献综述，就是国内外对此问题的研究进度的阐述！
个人认为，博士，硕士和本科生的论文对于一个课题的研究深度是不同的，本科主要是让学生通过论文学习到解决问题的能力，硕士和博士是他们通过学习到的更加专业的知识，对某一个课题进行更加深入的研究。
本科毕业论文与硕士论文的结构没有差异，差异在选题的深浅、宽窄。 本科毕业论文一般包括：论文摘要，关键词、目录、正文、注释、参考资料等
不可以一样硕士论文要检测查重硕士论文的研究深度另外论文字数，参考文献，论文综述那些都不同
那就是签名不一样的，不一样的签名，可信度和使用的作用就是有差别的。
