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这是审阅者将您的论文中有关文字标注为红色,表示引起您的重视,需要您重新核对、推敲、修改的意思,具体的修改意见要具体问题具体分析,拿不准的情况下可与审阅者沟通。 
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论文批注是写论文时把写论文的感想、疑难问题,随手批写在书中的空白地方,以帮助理解,深入思考或者便于日后修改论文的东西。论文批注是记录论文心得体会精读文章常用的一种方法。做批注的方法赏析语言特色(如修辞生动、动词准确、修饰语精当、哲理深刻)评点人物生发联想剖析写法批判文本质疑问难
我的也是写的“带格式的:突出显示”,带格式的是表示老师修改过了,但是 突出显示到底是个什么意思?
当然,那是导师直接在你的论文上修改,会用到一些格式,标注啊,这样你才能看得比较清楚,你也能分清哪些是导师修改的,所以那些是相当于批注的东西,你的word版本完全没有问题,放心。