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一般，委培生论文的课题，经费，资料都来自单位，因此这一协议没有明显违法之处，如果签了应该遵守。 
论文的通讯单位就是通讯作者的第一单位。据了解，有多位通讯作者时有三原则：首先看，通讯地址顺序最上面的通讯作者优先原则;相同通讯作者单位时看，通讯作者标注写在前面者为第一通讯作者。第三，有些期刊论文格式中不标注的，最后一个是第一通讯作者。“通讯作者”是指课题的总负责人，承担课题的经费、设计，文章的书写和把关，对论文内容的真实性、数据的可靠性、结论的可信性、是否符合法律规范、学术规范和道德规范等方面负全责(或主要负责)。 通讯作者即文章最重要的作者，在论文投稿、修改直至被接受发表的过程中的一切联络工作一般由通讯作者负责。目的是为了让文章读者和作者联络方便。
学位论文的话，这个不是专利，而是版权问题，首先你要看你写的学位论文是否是培养单位培养的方向，如果是，那么就是属于培养单位的。还有他们是否委托你写这篇学位论文的，如果是，那么也是那篇论文也是属于单位的。最后就是你写那篇论文是否利用了单位的培养经费、设备之类的，如果是，那么也是属于单位的。当然，你可以跟单位谈判，就是说你有署名权，或者要单位给与你多少奖金。这些都是法律允许的。
