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差不多,无所谓好与不好 
期刊更专业。论文也可以分为学术论文和普通论文,论文的类型其实和期刊的级别是相呼应的,比如省级期刊发表的论文就是省级论文发表,核心期刊发表的论文就是核心期刊论文发表,当然也可以分为国内学术论文发表和国际学术论文发表。论文和期刊是相互独立的,也是相互联系的,论文发表在期刊上才是对文章价值的最高认可,也是个人晋升的硬性要求,可以说期刊和论文甚至伴随一个人成长发展的各个阶段,充分利用期刊和论文必然会让自身的学术水平得以提升,更好的实现个人发展。
这么说吧,期刊论文由于期刊版面有限,所以只能用有限的篇幅进行阐述,所以期刊论文强调精炼,通常都是学位论文中的一部分拿来投期刊论文。一般要求主题创新、方法创新、观点创新、模型创新,当然了,有些一般的期刊就没那么多要求,给钱就行。学位论文则强调对问题有深入、全面、细致的了解,篇幅通常3万字以上,博士论文就更长,差不多一本书,分很多章节的,每一章节都有不同的论证。
一般引用,肯定是公开发表了的。建议拿博硕论文发表的平台跟期刊对比一下。期刊跟期刊之间也是有对比的,比如:级别。如果实在不好对比,可以找你导师沟通沟通。