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有三种原因。第一，该博士论文涉密，不能在网上公开，这种情况占比不多。第二，该博士所在学校未与知网签约。第三，该博士对自己的论文缺乏自信，害怕有人找事，因此从知网撤回。2010年之前的学位论文大多不查重，当时的政策也没有要求查重，按现在的标准来看，不少博士论文的重复率高，害怕有人找麻烦就主动撤回了。 
知网上的都是优秀硕士或博士论文，一般的论文都在原大学存档，在教育部的相关部门也有备份
学位论文属于本科的话在知网上找不到。知网文献检索到目前为止还不收录本科毕业论文，查询知网的文献只会跳出期刊、硕博论文。但是知网的查重论文比对库则收录本科毕业论文，一方面与知网存在合作关系的高校会将学生的毕业论文上传到知网，另一方面只要是使用知网查重的毕业论文都会自动被收录进比对库。各个高校也有自己的论文数据库，每一篇毕业论文也会被收录在内，而且毕业论文最终都要打印出来装订成册上交学校。所以说本科毕业论文肯定是被保存下来了，但是查看的话可能比较麻烦。
有的论文是保密的，我在档案馆工作过，看到好多论文都有保密年限，2到5年不等，还有有的大学不提交自己的论文材料等等，指望也不可能涵盖所有的硕士论文啊。
