贤掌门
建议你多多参考下（微生物前沿） 
毕业论文一般要结合具体实验，如果跟着导师做过一些相关实验，然后结合一些文献就好写了。一般来说会有一个书写提纲，每个学校应该都有自己的规范，这个导师应该很清楚，或者问下学长，祝你早日完成。
微生物生态学是研究微生物与生物、非生物环境之间相互作用的现象、过程和机理。主要研究内容有：1 研究微生物生态学所用的传统和现代分子生物学方法；2 在正常自然环境中的微生物种类、分布及其随着不同的环境条件变化而发生的变化规律；3 在极端自然环境中的微生物种类和它们所起的作用，在极端环境中微生物的生命机理；4 在自然界中微生物之间的相互关系，微生物与动植物之间的相互关系，这些相互关系对自然界的影响和环境因素对这些相互关系的影响
