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用制表位对齐,网上有很多查一下就行。我就用简单的,在段首相应的水平标尺上用鼠标点一下。然后用TAB键对齐正常情况下,可以对齐,这是后面没有标点符号的情况下,若有标点符号,系统需要自动调整保证行最后的标点符号符合习惯,所以每行都要调整字符间距。这样上下两行的文字就会出现错位。你可以通过设置:工具----选项,取消自动字符调整,这样就可以对齐。 
从新进行修整。参考文献加标注一般是在引用文字的末尾点击插入引用脚注和尾注,选择尾注就可以了。参考文献应该属于尾注,在菜单里选插入、引用、脚注和尾注。脚注是在文章的某一页下面的注解,而尾注就是在文章最后了,打开后就可以选编码,即角码。可以自己设定类型、格式。双击编码就可以在文章和参考文献间转换。