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不会，查重只查找正文内容 
据学术堂了解，本科论文摘要是需要查重的，虽说有些论文的摘要是在论文里摘抄出来的，但为了保障论文的完整性在检测论文时，也是需要论文摘要查重的也会有红色字体进行标注的。 为了防止摘要重复率过高会影响到全文的重复率，论文摘要的格式一定要正确尽量用自己的语言进行描述。
论文中的脚注不会查重的，查重主要是针对论文的正文部分，你可以在正文部分每隔23个字就改动一二个字，这样就不太会有问题了。
一般来说论文的摘要、参考文献是不需要进行论文查重的，但是具体需要看你所在学校的要求，有些学校是需要进行这部分的查重，有些则不需要进行论文查重。
论文中的脚注不会查重的，查重主要是针对论文的正文部分。很多网站都可以做论文查重，但是学校一般只认可权威的知网查重。知网查重的算法一般会检测论文的目录，可以分章检测。然后就会检测论文的摘要以及正文等内容的重复度。根据权威网站的查重算法，可以知道系统是没有检测图片和公式。一方面这些资料计算机不好进行比对，另一方面论文侧重于文字的检测。这对大多数学生来说是个好消息。论文抄袭的字数1、反抄袭软件检测到13个相同的字，就以为是相似，所以连续相似的，不要超过13个字；2、尽量用同义词代替，例如：损坏=毁坏；渠道=途径；原理=根本思绪；不可见=躲藏；优点特别突出=优势尽显无疑。3、改动句子的主动语态，比方：数字水印为多媒体数据文件在认证、防伪、防窜改、保证数据平安和完好性等方面提供了有效的技术手腕。在多媒体制品的认证、防伪、防修改和传送平安以及完好性保证方面，能够采用数字水印的检测作为有力的检测手腕。
