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主要功能有：（1）中国知识资源总库；（2）数字出版平台；（3）文献数据评价；（4）知识检索。1、中国知识资源总库：提供CNKI源数据库、外文类、工业类、农业类、医药卫生类、经济类和教育类多种数据库。其中综合性数据库为中国期刊全文数据库、中国博士学位论文数据库、中国优秀硕士学位论文全文数据库、中国重要报纸全文数据库和中国重要会议文论全文数据库。2、数字出版平台：数字出版平台提供学科专业数字图书馆和行业图书馆。3、文献数据评价：《中国学术期刊影响因子年报》系列数据库的研制出版旨在客观、规范地评估学术期刊对科研创新的作用，为学术期刊提高办刊质量和水平提供决策参考。4、知识检索：提供以下检索服务：文献搜索、数字搜索、翻译助手、图形搜索、专业主题、学术资源、学术统计分析。 
知网查重检测系统的数据库包括：中国学术期刊网络出版总库;中国博士学位论文全文数据库/中国优秀硕士学位论文全文数据库;中国重要会议论文全文数据库;中国重要报纸全文数据库;中国专利全文数据库;互联网资源(包含贴吧等论坛资源);英文数据库(涵盖期刊、博硕、会议的英文数据以及德国Springer、英国Taylor&Francis 期刊数据库等);港澳台学术文献库;优先出版文献库;互联网文档资源;图书资源;CNKI大成编客-原创作品库和个人比对库。由第一点可知，知网论文查重还有两个特有的数据库——“大学生论文联合比对库”和“学术论文联合比对库”，分别包括在知网本科pmlc系统和知网硕博VIP系统之中。
