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按研究的学科，可将学术论文分为自然科学论文和社会科学论文。每类又可按各自的门类分下去。如社会科学论文，又可细分为文学、历史、哲学、教育、政治等学科论文。 
一、指代不同1、基础研究：指认识自然现象、揭示自然规律，获取新知识、新原理、新方法的研究活动。2、应用研究：指为获得新知识而进行的创造性的研究，它主要是针对某一特定的实际目的或目标。二、特点不同1、基础研究：为了认识现象，获取关于现象和事实的基本原理的知识，而不考虑其直接的应用。2、应用研究：具有特定的实际目的或应用目标，具体表现为了确定基础研究成果可能的用途，或是为达到预定的目标探索应采取的新方法（原理性）或新途径。三、准则不同1、基础研究：没有特定的应用目的或目标主要表现在，在进行研究时对其成果的实际应用前景如何并不很清楚，或者虽然确知其应用前景但并不知道达到应用目标的具体方法和技术途径。2、应用研究：应用研究在获得知识的过程中具有特定的应用目的。或是发展基础研究成果确定其可能用途，或是为达到具体的、预定的目标确定应采取的新的方法和途径。基础研究的特点是： 1、以认识现象、发现和开拓新的知识领域为目的，即通过实验分析或理论性研究对事物的物性、结构和各种关系进行分析，加深对客观事物的认识，解释现象的本质，揭示物质运动的规律，或者提出和验证各种设想、理论或定律。 2、没有任何特定的应用或使用目的，在进行研究时对其成果看不出、说不清有什么用处，或虽肯定会有用途但并不确知达到应用目的的技术途径和方法。 3、一般由科学家承担，他们在确定研究专题以及安排工作上有很大程度的自由。
研究目的不同：基础研究是弄清基本的概念基本的方法，应用研究是弄清具体的问题如何为具体对象服务。
根据不同的标准，学术论文有不同的归类。从选题的属性分，有基础理论研究论文和应用研究论文:从学科内容分，有一般学术论文和规范性学术论文(学位论文);从写作方法、表述特点分，有评论型论文、评述型论文、论述型论文。
我不知道你说的学术论文是哪哪一种学术论文，学术论文，现在包括期刊型的论文，就是发一些省级，国家级核心，还有一些世界级别的期刊，那这些也是从作为学术论文。
论文主要是学位论文和期刊论文。学位论文主要是毕业答辩时的论文，也就是我们所说的大论文。期刊论文主要是让你达到毕业要求用的，是发表在期刊上的，也就是我们所说的小论文。期刊论文有主要有两种，一种是综述类的，内容主要是总结之前相关领域所做的研究。还有一种是实验型的，内容主要是通过实验得出的一些结果或者是结论。
