mojiemouse
不会。本科生发表论文如果想被知网收录,必须将论文发表在能被知网收录的期刊上。知网是不收录毕业论文的,或者个人论文。有些学生的毕业论文比较优秀,导师会提交给图书馆,再由图书馆提交给知网,而知网也只是酌情收录,并不一定全部收录。知网对图书馆提交的研究生论文和博士论文是比较青睐的,也容易收录。而本科生一般发表论文想被知网收录,还是要通过被知网收录的期刊来发表出去。 
个人觉得,过高的收费在行业内部并不合理,甚至也不合法。
问题的关键在于你说的最后一句话,编辑给你说是学术性期刊,估计你是发到一号多刊的刊物上了,是那种所谓的“学术版”
其实CNKI收录的是期刊一般都有正式的出版刊号即国内刊号CN号,还有一部分是以书代刊的出版物,有书号而没有刊号,学校可能不认可这一部分,所以被CNKI收录了,但学校不认可。