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第一条 工程硕士学员在修满规定的学分后,可以进入学位论文撰写阶段。
第二条 工程硕士学员学位论文指导老师的选择,以师生互选和工程硕士中心协调相结合的方式选定。
第三条 工程硕士导师选定后,学员应积极加强与导师的联系和沟通,在导师的指导下初步确定研究方向,通过查阅文献、收集资料和调查研究,结合所在行业工作特点及自身兴趣专长,与导师商讨拟定论文选题。
第四条 选题要求:工程硕士专业学位论文选题应直接来源于生产实际或具有明确的工程背景,其研究成果要有实际应用价值,论文拟解决的问题要有一定的技术难度和工作量,论文要具有一定的理论深度和先进性。鼓励学员结合工程硕士培养过程所学的理论知识,在调查研究的基础上,根据自身的工作经历选择题目。
第五条 项目管理领域工程硕士学位论文选题应注重工程性和项目导向性,应解决一个(或以上)完整的项目管理问题。鼓励学员选择建设工程、信息工程、制造工程、农业工程、国防工程等相关工程领域中,能促进项目管理理论发展的论题,以及提高项目管理应用水平的案例分析和实证研究等方面的论题,最好是有针对性地选择本人所在企业或部门的实际项目管理问题,运用项目管理理论和方法展开研究。
第六条 物流工程领域工程硕士学位论文选题应直接来源于物流领域实际工作部门,并与学生的本职工作联系紧密。论文可以是一个完整的工程技术项目,或某工程项目的子项目,必须有相关方案的比较、评估、设计计算和完整的图纸等相关文件;可以是某项规划、设计项目,必须有相应的技术经济比较;可以是新产品、新流程、新方法的设计和开发,必须有设计开发的全部技术资料以及分析;可以是某物流信息系统的设计和开发,必须有系统的相关技术文档以及相关软件;可以是经营管理的成果,必须有新的经营管理理论、方法和效果分析等。
第七条 项目管理领域工程硕士学位论文形式可以是项目管理理论方面的专题研究,也可以是将项目管理理论应用于所从事工作的解决问题的文章,以及典型性的项目管理案例研究。物流工程领域工程硕士学位论文形式可以是结合物流工程技术项目的论文,也可以是物流工程规划、设计、开发及成果分析研究的论文。
第八条 选题确定后,填写《工程硕士论文选题登记表》并在课程结束后的2-3个月内提交到工程硕士中心,逾期将不予受理。未能提交论文选题表的学员,不能进入论文开题阶段。 
物流工程毕业设计有:各类物流企业,工商企业的物流管理部门,各级物流行政管理部门,交通运输企事业单位,物流设备研发、物流系统设计、物流成本分析、物流运输管理。物流工程主要研究物流学、运筹学、管理学、交通运输组织学、运输经济学、运输商务管理等方面的基本知识和技能,在物流、交通运输、机械制造等企业单位进行物流系统的规划设计、物流技术设备的研发、物流成本的分析与控制等。例如:自卸式货车、冷藏车、分拣设备等物流设备的研发,自动识别、自动分拣系统的设计等。