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是可以的,现在计算机技术非常普遍,中医理论与计算机专业课程教学结合,不仅体现在教学中,还可以应用于科研研究进行数据分析和整理,以及在管理中得到普遍运用。这个是计算机在许多应用领域都将会有很好的结合和前景。 
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看你想研究那些方面了,多看看别人的论文就有思路了,有本《中医学》里面挺多的
学术堂整理了二十条中医学毕业论文题目,供大家参考: 交融渗透 相得益彰--论中医学与中国传统文化的互动关系 关于中医学学科建设的医史学思考 中医学"卓越医生"胜任力特征模型的构建 中医学的科学定位 中医学教育开展PBL教学之短长 重构中医学理论体系--中医学二次革命、四次浪潮的先导工程 初议中医学是复杂性科学--中医标准化预备研究之二 中医学的学科属性与其现代化刍议 再论中医学的双重属性 从中医思维方式探讨中医学的发展 论模糊数学与中医学 复杂网络理论及其在中医学研究中的应用 我国中医学期刊引用网络分析--基于CMSCI(2004-2012)年度数据 中医学的特点、特色和优势 中医学为何要现代化--中医学现代化再拷问 中医学与复杂性科学 试论中医学与中国传统文化的关系 客观唯心思辨是中医学理论体系的基石--重新认识中医学的"阴阳五行" 从地方性知识的视域看中医学 瑜伽与中医学探究