cafeboy
你要搞清楚一件事,毕业论文又叫学位论文,是提交给学校的,不是发表的。在会议或者期刊上发表的叫学术论文。你当然可以把毕业论文里面的内容写成学术论文拿去发表。导师不在学术论文上署名当然也可以,但是你们学校是否承认就不好说了。我们学校就规定:导师不署名的学术论文一律不得用于申请学位。所以你要看你们学校的规定。 
这个不存在违法的问题吧,导师不同意你也没办法,千万不要和导师发生强烈的冲突哦,否则很有可能会被延期毕业哦,就算是你告到学校估计也没办法。所以首先你应该和导师好好聊聊,最好带点礼物说一说自己的情况,看看能不能争取到同情。如果不行的话你就安安稳稳的在实验室呆着吧,没有别的办法。
那肯定是一旦刊登出来对他的利益有冲突。他不想让其他某些人了解到他现在的情况。