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1、区别：参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目，集中列表于文末；注释主要包括释义性注释和引文注释，一般排印在该页地脚或集中列于文末参考文献表之前。2、注释。是对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。为了保障原作者的著作权。3、参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T 7714—2005《文后参考文献著录规则》的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。”根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。 
尾注：论文中，你借鉴过来的观点、名词。数据等（就是抄来的），就需要用尾注，标明是从哪里抄过来的。尾注，你可以自己标个号，随便找个论文都有的（1、2、3啥。尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。注释：对一些专门、专业词汇的解释，论文中有些词，看论文的人不懂，作者觉得有必要注释的话，就标一下，一般用脚注，就是每页的最底下对本页的词汇进行注释（每页标个注1、注2或者a、b、c 就行）。如果索引有编号了，就把尾注和脚注分别用索引的编号就行，索引也是你自己写，索引的编号和尾注和脚注的编号一致就行，注意索引的编号后附上页码。word 文档中可以添加尾注和脚注的，都是自动的，“插入”项下面可以找到。
在论文中如果你引用了书中的一句话或者一小段话，就需要用注释标出来 而参考文献则是指你为了写论文参考了那些书籍资料或者你的论文涉及到那些文献
注释，著作权法术语，指对文字作品中的字、词、句进行解释。目的是为了让别人和自己很容易看懂。为了让别人一看就知道这段代码是做什么用的对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。包含的内容很广。诸凡字词音义、时间地点、人物事迹、典故出处、时代背景都是注释对象。有脚注、篇末注、夹注等形式。古籍注释列在正文之中，有双行夹注和夹注。现代书籍注释列于正文当页之下，称脚注，亦称本面注；列于文章之后或列于书籍之后者称篇末注。 参考文献，著作权法术语，指撰写或编辑论著而引用的有关图书资料称之为参考文献，参考文献是出版物不可缺少的重要组成部分。凡引用前人或他人的观点、数据和材料等都要在文中出现的地方标明，并在文末或书末列出，这项工作叫参考文献。
参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目，集中列表于文末；注释主要包括释义性注释和引文注释，一般排印在该页地脚或集中列于文末参考文献表之前。释义性注释是对论著正文中某一特定内容的进一步解释或补充说明；引文注释包括各种不宜列入文后参考文献的引文和个别文后参考文献的节略形式参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目，集中列表于文末；注释主要包括释义性注释和引文注释，一般排印在该页地脚或集中列于文末参考文献表之前。释义性注释是对论著正文中某一特定内容的进一步解释或补充说明；引文注释包括各种不宜列入文后参考文献的引文和个别文后参考文献的节略形式。
