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我遇到的同样问题是2007的页码到2003时页码紊乱现象。 
以Word2013为例： 单击“视图”选项卡下的“大纲视图”（图1）； 删除其中的“分节符（连续）”、“分节符（下一页）”、“分节符（偶数页）”和“分节符（奇数页）”，关闭大纲视图，简单排版一下（图2）； 双击第一页的页脚区域，调出“页眉和页脚工具”选项卡，删除原来页脚后，单击“页码”下拉箭头，设置页码格式，从“页码格式”对话框的“编号格式”里选择满意的编号格式，设置“起始页码”为“1”，点击“确定”关闭对话框（图3）； 从“页码”下拉箭头中选择将页码插入页面底端，单击一种样式，即可插入页码（图4）。
如果你想从第二页开始插入页码的话，最简单的方法是：在”页面设置“中的”版式“中选择”“首页不同”，如果你想从第X页开始插入页码的话方法是：X代表你想插入的页码1、将鼠标定位在第X-1页的最后一个字符后 2、选择“插入-〉分隔符”；在“分节符类型”选项中，选中“下一页”；按“确定” 3、将鼠标定位到第X页 4、选择“插入-〉页码”；将“首页显示页码”勾上（因为页面默认是“首页不同”） 5、按“格式”键；勾点“起始页码”，选择“1” “将第X页设为第1页的问题”就解决了；但还要执行下面这一步 6、双击第X页的页脚，出现“页眉和页脚”工具图标，同时页脚区域会显示“与上一节相同”的提示（如果没有此提示，下面的步骤就不用执行了） 7、点击“页眉和页脚”工具图标中“链接到前一个”按键后，页脚区域显示的“与上一节相同”的提示消失； 8、点击“页眉和页脚”工具图标中“关闭”按键；至此就ok了 对第X-1页及之前页无页码的处理： 双击第X-1页的页脚，将显示页脚数字的栏位删掉即可
你的问题应该是分隔符引起的，你可以全部重新插入页码，从第一节开始，第二节插入页码的时候页码编号一定要选择继续前一节，而不是重新开始编号，否则就会混乱。
