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一般来说，论文的脚注不会算入查重，所以应该要注意标题、摘要、正文的查重哦，在发表之前最好使用知网获得早检测系统先查重。 
脚注被标红一般都是插入格式不对。论文上传的是PDF格式还是Word格式可能会对结果产生影响，因为当上传PDF检测时，PDF会比Word多一个文本转换过程。这个过程很可能会破坏你原来正确的目录和参考格式，目录和参考格式会被混淆，导师系统会被错误地识别并标记为红色。以知网为例，在格式正确的情况下，使用word版本长传文件，一般不会被标红，但是很多同学直接上传PDF版本，这样就可能被标红。因为PDF在系统中进行文字转化的时候可能会出现识别不准确的情况，也无法识别这个部分是你的参考文献，当然就会被标红啦。所以在学校没有明确规定必须以PDF版本上传时，一定选择Word版本上传。如果不是常见的主流检测系统，数据库可能会比较杂乱，检测算法也不够正规，所以参考文献被标红的情况也会存在。所以建议大家为了获得更准确的检测报告，并且更高效地查重降重，尽量使用学校指定地检测系统，比如知网、维普、万方等这些比较常见的主流查重系统。
论文中的脚注不会查重的，查重主要是针对论文的正文部分。很多网站都可以做论文查重，但是学校一般只认可权威的知网查重。知网查重的算法一般会检测论文的目录，可以分章检测。然后就会检测论文的摘要以及正文等内容的重复度。根据权威网站的查重算法，可以知道系统是没有检测图片和公式。一方面这些资料计算机不好进行比对，另一方面论文侧重于文字的检测。这对大多数学生来说是个好消息。论文抄袭的字数1、反抄袭软件检测到13个相同的字，就以为是相似，所以连续相似的，不要超过13个字；2、尽量用同义词代替，例如：损坏=毁坏；渠道=途径；原理=根本思绪；不可见=躲藏；优点特别突出=优势尽显无疑。3、改动句子的主动语态，比方：数字水印为多媒体数据文件在认证、防伪、防窜改、保证数据平安和完好性等方面提供了有效的技术手腕。在多媒体制品的认证、防伪、防修改和传送平安以及完好性保证方面，能够采用数字水印的检测作为有力的检测手腕。
不会。因为脚注是比较特殊的，有专门的标注符号，所以一般是不计入查重范围内的。脚注也就是说把引用到的论文内容或者所引用的论文内容涉及到与其相关出处的内容，用脚注的形式标出来。
