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课程设计是为一门课或者一节课如何讲解进行预先整体设计。比如明天你要讲公开课，除了写教案，你还得对授课形式、辅助工具等进行安排。，一句话，课程设计不是论文。 
论文：是对某一事物的解释。也有毕业论文。毕业设计：是在大四的下学期，这一个学期都要从事的工作，也是一个必修环节，是对你本科所学知识的融会贯通。针对你四年来所学的知识，做一个实体出来，比如你学的计算机专业，你可能就会做个XX系统，XX网站出来。最后还需要答辩。课程设计：针对你学完的某一门课，最后做的设计，比如说你学过了机械设计这门课程，老师会安排你专门抽出两周左右的时间，给出一些机械设计相关的题目，可以任选其一（一般可以组队），完成这个题目，最后要做简单的答辩。
毕业设计是你大学4年的总结，基本上要在最后一个学期内完成，一般是自己或老师帮你选一个题目，然后自己去实验或调研，完成自己的毕业设计，最后要通过论文的形式表现出来，所以可以说毕业论文只是毕业设计的一部分，也是最重要的，毕业设计其他的你可以不做但不能没有毕业论文。毕业设计的成绩基本也是以你的毕业论文和答辩成绩为主。
不一样，区别如下：一、指代不同1、毕业设计：是指工、农、林科高等学校和中等专业学校学生毕业前夕总结性的独立作业。2、毕业论文：是专科及以上学历教育为对本专业学生集中进行科学研究训练而要求学生在毕业前撰写的论文。二、内容不同1、毕业设计：在教师指导下，学生就选定的课题进行工程设计和研究，包括设计、计算、绘图、工艺技术、经济论证以及合理化建议等，最后提交一份报告。应尽量选与生产、科学研究任务结合的现实题目，亦可做假拟的题目。学生只有在完成教学计划所规定的理论课程、课程设计与实习，经考试、考查及格后始可进行。是评定毕业成绩的重要依据，学生通过毕业设计答辩，成绩评定及格才能毕业。2、毕业论文：题目由教师指定或由学生提出，经教师同意确定。均应是本专业学科发展或实践中提出的理论问题和实际问题。通过这一环节，应使学生受到有关科学研究选题，查阅、评述文献，制订研究方案。
毕业论文是文章类的东西，毕业设计是一个整体，可以包含论文，还可能有其他的实物等物件，课程序设计只是一门课程结束后的一道作业题的设置可能是一个系统的片断。
