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两者只是针对论文不同阶段进行查重修改，初稿是论文最开始的雏形，而定稿是可以提交到学校检测的阶段。初稿查重最大的作用，就是避免后期定稿大量修改调整的麻烦。同学们准备向学校提交论文前，终稿需要不断进行查重，重复率一定要在学校要求之下，要不然提交论文之后很容易被打回来重改，这样可能会影响毕业。初稿查重：还没有最后完成的论文、没有正式发布的文献作品或没有经过精准的修改、完善的论文，都可叫做初稿。其实论文初稿查重还是很有意义的，其一可以让我们先确定论文论点是否得到正确使用，文中使用的参考文献是否出现大面积重复。其二可以提前完成对论文查重率的降低，避免后期定稿修改调整浪费时间。定稿查重：定稿是经过初稿的修改和征求导师的意见，之后针对导师的建设性意见我们对论文进行多次修改，最后的一版就是定稿。定稿通过学校指定的查重网站检测查重率，只要查重率在学校指定的范围之内就是通过了。论文可以看作是学校最后对学生的评价，论文还涉及到学生自身拥有的专业知识程度和理论储备。其实无论是初稿还是定稿，都有必要对论文进行检测，因为这样有便于同学们时刻了解论文的重复率，并及时对论文内容进行修改调整。 
毕业论文在定稿前和定稿后都是可以进行查重的。且论文定稿后，建议大家使用跟学校一致的论文查重系统进行查重，这时就能够较为可靠的保证论文的查重率与学校的检测结果吻合。论文定稿之后，就不建议大家再进行大面积的修改了，因为这样很有可能导致整篇论文的行文结构越来越乱，反而会给自身带来不必要的麻烦。
