stereo126
你修改的地方要在cover letter中表明，一条一条的写清楚，不要嫌麻烦。你应该提交一个修改好的上面没有任何标记的手稿，以备发表时用。 
论文在修改稿上需要有批注的，这样有利于1，整理自己的思绪，知道当时的想法。2，很多时候修改的想法都是灵光一现，后面自己都不知道为啥会这样改，之前是什么样的。3，方便做对比比较，修改的有可能会出现不如之前的情况。
我也是刚做完毕业论文，也算是过来人了，对这个还算是比较了解：尤其是在近来全国高校教学评估的大背景下，毕业论文中所有的参考文献都是需要在正文中标注的，要不然你的指导老师肯定会让你一而再再而三的修改的受到启发的文章当然也可列为参考文献，因为你既然受到了启发，你就应该把启发的背景介绍一下，这必然就是参考文献的内容，所以同样应该标注的
引用、参考的文献都应当用上标标出，这个是学术论文的规范做法。毕业论文本身就是学术性的论文，理应按照规范来写。不规范的后果很可能 是被导师打回来修改，有的学生毕业论文写了四稿以上，大部分是论文格式等问题，所以劝你还是写的时候弄好一点，以后改的话会很麻烦的。篇文章没有在文中直接或间接引用，只是看过了有点启发，也可列为参考文献，并应在正文中标出。（可标在应用了这个“启发”的那一段末）
