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毕业论文，泛指专科毕业论文、本科毕业论文（学士学位毕业论文）、硕士研究生毕业论文（硕士学位论文）、博士研究生毕业论文（博士学位论文）、博士后毕业论文等，即需要在学业完成前写作并提交的论文，是教学或科研活动的重要组成部分之一。毕业设计一般是理工科学生毕业答辩前的功课，要自已设计一套系统（各专业要求不一样），比如软件专业要设计一个程序或者是某个小型数据库之类的，再来证明其可行性，理论基础等。由此形成的对于这个设计的解释性文字就是毕业论文。 如果是文科专业的，就没有毕业设计，只有毕业论文了 
毕业论文，一般是选择和自己专业相关的。当然，你如果想要选择其他课题，也可以和导师沟通商量，他同意了你才可以选择其他课题。
论文是理论的文字阐述，毕业设计是你实际的操作方案。
两者各有所长把。做设计能够把所学知识应用到实际工程当中去，研究性的论文更多的是一种探索，一种尝试。如果你将来希望从事的职业是应用性的，选择设计类的比较好；如果你将来想进研究所之类的研究机构，可能研究性的论文会好点，但这个也不是绝对的
