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原子是一个小球，分子是两个或者几个小球组成的整体，离子是带电荷的原子或者分子（带电的小球）。 共同特征：都是组成物质的最基本的粒子。 不同特征：物理、化学性质各不相同。 
图中＋－号代表不可分割的最小正负电磁信息单位-量子比特（qubit）（名物理学家约翰惠勒John Wheeler曾有句名言:万物源于比特 It from bit量子信息研究兴盛后，此概念升华为，万物源于量子比特）注：位元即比特
1、以分子形态存在的物质（1）常温下的气体均以分子形态存在；（2）大部分非金属单质（除C、Si、B外）以分子形态存在，其中许多以双原子分子形态存在，如卤素、氧气、氢气、氮气等。也有三原子分子，如臭氧。还有4原子分子，如白磷。更多原子的分子，如硫、红磷等等。（3）大部分共价化合物（除SiO2、SiC、BN等外）（4）稀有气体单质为单原子分子。2、以离子形态存在的物质它们均为离子化合物，是以阴阳离子通过离子键构成。（1）按物质类型看，主要有：活泼金属氧化物、氢氧化物（强碱）、部分盐、金属碳化物等。（2）以元素组成看：活泼金属与活泼非金属形成。其中活泼金属可以用铵根离子代替，活泼非金属可以用氢氧根、含氧酸、拟卤素、复杂同一非金属如C22－、O22－、S2~52－等。3、以原子形态存在的物质它们在固态时为原子晶体，拥有很高的硬度，很高的熔沸点。（1）部分非金属，如金刚石、单晶硅、晶体硼等。（2）部分共价化合物，如SiC、SiO2、AlN、C4N3、BN等等。
