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都是要经过这些单位的程序才能完成杂志的出版，要审稿，出版，印刷。三步曲。 
论文发表机构指的就是专门帮忙发表论文的机构，就是论文发表网站，不过现在这种网站比较多，骗子也比较多，有的是不是骗子，但是给你安排的刊物好像也可以，就发评职称不能用，这样的也需要警惕。如果你实在想发表论文，建议你先去淘淘论文网上阅读下相关的文章，先学习下论文发表知识和期刊知识。
论文发表单位是指您论文刊发的杂志所属的期刊杂志社名称。如您的文章发表在《武汉大学学报（医学版）》，发表部门就是：武汉大学学报编辑部鉴定部门，这个还真不知道您所指的鉴定是什么鉴定。可以追加提问，帮您解答
