古城萧?
论文发表单位是指您论文刊发的杂志所属的期刊杂志社名称。如您的文章发表在《武汉大学学报(医学版)》,发表部门就是:武汉大学学报编辑部鉴定部门,这个还真不知道您所指的鉴定是什么鉴定。可以追加提问,帮您解答 
按理说吧,第一单位应该是获得学位的单位,最好问清楚,看有没有合约之类的,说明署名单位的情况。你拿联培单位作为第一单位的文章是不可能获得你学籍单位的学位的,否则联培就失去了其意义了。我不清楚两边拿学位的情况,问清楚吧,不然以后拿不到学位就麻烦了。
就是发表一篇学术论文。研究生在读期间发表的学术论文应以自己的学校为第一署名单位。在医学院认定的国内外一流大学联合培养一年以上,完成论文相关课题研究的研究生,其论文署名单位可根据论文完成的贡献度进行排序。