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G伽利略在1609年，根据望远镜倒视有放大物体的效应，制成一台复合显微镜，并对昆虫进行了观察。英国物理学家R胡克于1665年用自制的复合显微镜观察软木薄片，发现有许多蜂窝状小空室并称之为细胞(cell)。这个名词一直沿用至今。这张软木显微结构图，登载于1665年英国出版的《显微图谱》上。他还对鱼鳞、蜜蜂螫针、家蚕卵、家蝇的头和足以及跳蚤等进行了精细的描绘。 意大利解剖学家M马尔皮基开创了动物与植物的显微解剖工作。1660年他通过向蛙肺动脉注水的方法，发现有连接动脉与静脉的毛细血管，证实了W哈维未能观察到的由毛细血管连接动、静脉的血液循环。他描述了肝脏的微细结构，舌的乳头突，大脑皮层，以及用他名字命名的肾小体和皮肤微细结构等。他对家蚕进行了显微解剖，发现同样具有复杂的微细结构。他关于家蚕的著作是无脊椎动物方面的第一本专著。他对不同的植物进行了比较研究，系统地描述了植物各部分的结构，指出单子叶植物与双子叶植物间的区别，以及虫瘿是由昆虫引起等。并且提出植物的各部分是由“小囊”（即细胞）组成的。他在植物解剖方面的许多精确绘图未能为当时的植物学家所理解，直到19世纪才被重新认识。 英国植物学家N格鲁在显微镜下发现植物叶面有气孔，它们可使植物体内的水分蒸发并吸入空气。他发现植物的组织是由多孔的小胞（即细胞）所组成，但他经 常描述的只是小胞的壁。他认识到花是植物的生殖器官，可区分为萼、花冠、雄蕊与雌蕊，并指出雌蕊、雄蕊和花粉分别相当于雌性器官和雄性器官，而且植物一般是雌雄同体的。他的著作《植物解剖》由M马尔皮基译成拉丁文，流传了100多年后才有人做了一些重要补充。 荷兰显微镜学家 Avan列文虎克自制了许多性能优良的显微镜，最高的放大倍数达270倍。他通过大量细微的观察，解释并完善了M马尔皮基提出的关于毛细血管系统的知识，证明动脉与静脉分别和毛细血管直接相连。他发现人和哺乳类的红细胞是无核的，而鸟类、两栖类、鱼类的红细胞是有核的；发现了人的精子，并研究了各种动物特别是鱼和蛙的受精作用；还发现了许多小的水生生物，如轮虫、水螅、纤毛虫等。还在19世纪显微镜改进之前，他首先看到并记述了细菌，实属难得。 荷兰显微镜学家J斯瓦默丹对不同类型的昆虫发育 做了许多研究。他的著作《昆虫志》、《蜉蝣的生活》 中有许多出色的显微解剖图，如昆虫的神经节，气管系 统等。他去世几十年后出版的《自然的圣经》是当时显微镜观察的最好著作，其中对蜜蜂内部器官、蚊子、蜻蜓发育的描述，都非常精确但由于复合显微镜的色差问题，使这方面的工作在其后的100多年内没有多大进展。 
今天上了一节科学课，老师给我们拿来了四台显微镜他要我们用显微镜来观察平时用肉眼看不到的东西我们听了，感到既新奇又兴奋老师首先要我们撕下一小块干净的白纸，再让我们用手去摸我们告诉老师它不但很平整而且很光滑，老师又让我们看了看它，非常干净等我们开始用显微镜时看的时候，纸的表面原来像山丘一样高低起伏，连绵不断，千沟万壑，有许多小的黑点哦!原来纸是这个样子的，难怪用墨水在纸上能留下痕迹因为下了雨，老师又叫我们到操场上的水洼去弄了一滴水，把它滴在载玻片上，放到显微镜下去观察我看到了几只像鞋底一样的虫子老师告诉我们它叫草履虫，它只有05毫米长，用肉眼只能看到一个小白点，用放大镜可看到它在动，只有用显微镜，才能看到庐山真面目!“有谁用显微镜观察过皮肤?”老师问，我们一下子会意了，老师要我们观察皮肤我们用镊子夹下手背上的一小块皮，放在显微镜下它就像一张地图，有许多交错的纹络，还有许多小黑点，这些黑点就像地图上标明的城市老师说那小黑点可能是灰尘，如果想看到皮肤细胞，那就只有用电子显微镜才能看到仿佛一眨眼的功夫，这节课就过去了，它不但让我长了知识，还让我悟出了一个道理：同一个事物，从不同的角度来观察，就会有新的发现
