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注释，著作权法术语，指对文字作品中的字、词、句进行解释。目的是为了让别人和自己很容易看懂。为了让别人一看就知道这段代码是做什么用的对书籍或文章的语汇、内容、背景、引文作介绍、评议的文字。包含的内容很广。诸凡字词音义、时间地点、人物事迹、典故出处、时代背景都是注释对象。有脚注、篇末注、夹注等形式。古籍注释列在正文之中，有双行夹注和夹注。现代书籍注释列于正文当页之下，称脚注，亦称本面注；列于文章之后或列于书籍之后者称篇末注。参考文献，著作权法术语，指撰写或编辑论著而引用的有关图书资料称之为参考文献，参考文献是出版物不可缺少的重要组成部分。凡引用前人或他人的观点、数据和材料等都要在文中出现的地方标明，并在文末或书末列出，这项工作叫参考文献。 
如果论文中某句话是直接引用别人论文的内容，就加注释。如果在写论文过程中看了别人的文章并有所启发，但没有直接引用别人的观点，那就加参考文献。一般注释需在正文中有序号与之一一对应，但参考文献只需在文章最后列出所有你在写文章时参考过的文章即可。
1、文本不同：脚注或尾注由两个互相链接的部分组成，注释引用标记和与其对应的注释文本，在注释中能够使用任意长度的文本，并像处理任意其他文本一样设置注释文本格式。参考文献是来说明正文内容的来源。2、位置不同：脚注一般位于页面的底部，可以作为文档某处内容的注释。而尾注一般位于文档的末尾，列出引文的出处等。参考文献是作者撰写论著时所引用的已公开发表的文献书目，集中列表于文末。3、适用不同：脚注是解释正文中某一个词和句，不便于在正文中解释，怕影响正文的连续性，而在页脚上面插入解释。是引用的一种，只出此刻当页，而不会出此刻此节的每一页。尾注与题注的形式差不多，一般用于这句话或者段落了，出自何处。在全文尾部给予说明，与正文资料相差很远，参考文献是论文内容上的划分。
脚注就是可以附在文章页面的最底端的，对某些东西加以说明，印在书页下端的注文。参考文献是在学术研究过程中，对某一著作或论文的整体的参考或借鉴。征引过的文献在注释中已注明，不再出现于文后参考文献中。按照字面的意思，参考文献是文章或著作等写作过程中参考过的文献。然而，按照GB/T7714—2005《文后参考文献著录规则》的定义，文后参考文献是指：“为撰写或编辑论文和著作而引用的有关文献信息资源。”根据《中国学术期刊（光盘版）检索与评价数据规范（试行）》和《中国高等学校社会科学学报编排规范（修订版）》的要求，很多刊物对参考文献和注释作出区分，将注释规定为“对正文中某一内容作进一步解释或补充说明的文字”，列于文末并与参考文献分列或置于当页脚地。
