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论文查重时引用识别现在没有统一的标准,基本上都是学校规定的论文写作格式,但检测系统的识别符号以中括号[1]为主 你下载这份论文查重修改秘籍,自已去看着修改。如果你现在要定稿了,我建议你用知网查重和paperright这两个软件,检测都比较严格。 
论文查重关于引用这一块是会设置一个阀值的,一般在5%左右,你引用的内容在这个范围内的会是检测不出来的,如果你超过了即使是标注了也会被视为抄袭,这是paperpaper查重系统对于参考文献这一块的要求。
如果论文存在抄袭,但是没有被论文查重系统标红原因就可能是你所用的论文查重系统里面没有把所抄袭的部分收录进去。但是如果换另外一个查重系统就可能会出现标红了,所以为了避免因为抄袭没有被检测出来,而导致最终论文不过关的情况发生。最好多用几个查重系统检测一下,并且使用比较权威的查重系统比较好,例如知网和维普之类的。