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有的论文是保密的，我在档案馆工作过，看到好多论文都有保密年限，2到5年不等，还有有的大学不提交自己的论文材料等等，指望也不可能涵盖所有的硕士论文啊。 
CNKI收录硕士论文只收国家级和校级的优秀论文，而且，是在和学校签署正规的版权协议之后才可以收录上网，供大家检索的另外，还可以了解一下相应的论文发布时间，CNKI的数字出版是有一定时滞的，但不会很长，一般硕士论文发布后的1-2月可以上网供大家检索使用
一般是要毕业答辩得"优秀"的论文才有资格传到知网上另外还要本人愿意好象要签协议的，最后手续办完有延迟的，08年答辩的可能要09年下半年才可以看得到 没有得优秀的一般不传到中国知网上，但是不管得什么现在毕业论文都必须通过学术不端检测，而且电子稿和纸质文稿要存档并且电子稿上传到学校图书馆。
知网上的都是优秀硕士或博士论文，一般的论文都在原大学存档，在教育部的相关部门也有备份
硕士论文版权在学校手里，你说了不算。有的学校论文直接就给知网了，知网给学校送点知网充值卡。有的学校论文不给知网，但是有本校论文库，这样知网就查询不到，发表普刊就没有问题。如果发表核心，那估计还是不行。“学术论文联合比对库”，知网的这个数据库比较厉害，你可以百度搜索这个库看看说明！都会记录到这个库，虽然不收录！
