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放心吧，已经提交的论文一般没人追究。 
开题通过后，基本应该按照开题报告来行文，如果有新的想法最好征得导师的同意再在正文中按新研究方法写，同时改动原开题报告，事关答辩，最后的成品最好前后一致。
根本不用担心你已经审核通过的论文。一、论文既然已经通过，必然受到导师及审评委员会通过和肯定的，没有人能够推翻论文的结果。二、论文只要不是抄袭的，不是窃取他人的成果的，已经通过的论文，都不应该受到质疑。三、不需要补救，也不需要忐忑不安，假如你有愿望的话，可以继续你的博士学历，在写博士论文的时候，再有新的发现和新的论述。四、硕士学位只要是经过正常审批渠道的，不存在撤销的现象，一切由评审委员会承担责任，个人不负任何责任。
