zouyunai
1 论文是你要发表的文章。2 专利，是你向国家申请要保护的技术方案。3 简单的来说就是这样。 
专利权是归申请人所有，谁申请，专利权归谁。 你说的这种情况，如果专利被授权，论文的作者可以去专利复审委员会宣告该专利无效，由于该专利不具备新颖性，新颖性是指在该专利申请日前，该发明或实用新型没有在国内外的出版物上公开发表过，使用过和为公众所知，也没有其他人提出过专利申请。
对方如果申请的是发明专利就不可能申请下来因为没有背后颖性，对方申请了你可以拿着这个论文把他的专利给否决掉，著作权是你自己的
