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论文格式对查重是有影响的，例如知网检测系统是对格式有严格的要求，例如目录和参考文献，都对格式有具体要求，知网会根据目录自动将文章分章节进行检测，对重复率还是有影响的，参考文献格式也十分重要。 
红色。绿色字体表达的意思是很容易理解的，它表达了没有检测到重复或者是重合的情况，只是其中引证的一些部分并没有太大的影响，所以查重报告里面出现很多绿色字体，则表明该论文的重复率处在一个相对较低的位置，红色以及深红色则表示字体内容重复的现象非常严重，红色所代表的重合比例占比高于百分之五十以上。黑色则表示没有重复，若是你的检测报告显示的大多为黑色以及绿色就表明你合格了。
学校规定的论文文件格式基本上都是Word，所以大家在上传论文至查重系统时，最好是上传Word格式的论文文档，这样查重系统在识别论文内容时不容易出错，同时也可以让查重结果更准确。虽然很多论文查重系统都支持多种文档格式，比如PDF、TXT等等，但是查重系统在识别这些文档内容时，并不能做到100%准确。像PDF这种图片形式的文档，会增加查重系统的识别难度，查重系统需要将图片转换成可识别的文字内容才能进行检测，这一过程可能会产生比较大的误差，甚至出现乱码，影响查重结果。所以，论文查重对格式还是有一定要求的。在进行论文查重时最好是提交Word文档，因为论文查重系统识别Word文档会更容易一些，主要也是以Word为主，这样查重系统才能准确识别论文各部分内容，排除掉不计入重复率的部分，查重结果自然比其他格式的文档要准确一些。
红色字体表示论文重复率在80%以上，绿色字体表示论文重复率在50%一下。而黑色字体表示论文没有被修改过。好像还有一个黄色字体，表示论文重复率在50%~80%。希望我的回答可以帮到你！
