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打开百度搜索,在搜索框中输入“PaperPass官网”,然后点击【搜索】;待页面跳转出搜索结果后,找到,点击进入;进入网站之后注册或登录账号,进入查重中心,将自己的论文复制或上传到系统;然后点击提交检测即可,一般情况下等待10多分种之后,检测报告就会出来,然后根据学校要求的查重率及检测报告中的建议,进行修改调整,直到论文查重率达到学校要求 
开题报告和任务书不参与查重,论文查重一般只会查正文部分,摘要、致谢、附录这些可以不用上传到查重系统进行检测的,具体以学校的要求为准。
这个要看你学校具体要求的,你学校要检测哪些就上传哪些,尽量和学校查重内容保持一致,这样检测的才一致。不过目录和参考文献在学校查重系统可以识别的,只要你的格式正确,系统可以自动剔除不算重复的。查重可以直接到图书馆查重,也可以到一些知网自助查重网站:学术不端网、PaperEasy、蚂蚁查重网等,全程自助安全!快速!
参考文献应该不算,因为提供的参考文献主要用于确定正文中重复的地方是否属于引用。