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论文的格式要按审核要求的格式写。专利必须按照专利法和专利法实施细则的规定来写。两者的差别是非常大的。 
1 论文是你要发表的文章。2 专利，是你向国家申请要保护的技术方案。3 简单的来说就是这样。
论文和专利都属于技术文献但实质有不同论文是某一学术课题在实验性，理论性或观测性上具有新的科学研究成果或创新见解和知识的科学记录，或是某种已知原理应用于实际中取得新进展的科学总结，用以提供学术会议上宣读，交流或讨论;或在学术刊物上发表;或作其他用途的书面文件，从这个定义来看，论文有时候完全是纯理论的东西，而且对论文所要表达的内容并无太多限制，只要是新的研究成果即可，包括纯理论的，如数学公式、科学发现等。论文带给作者的很多时候只是荣誉以及著作权。专利明显不同，专利可保护的内容有限制，象数学公式、科学发现、外科手术方法、克隆技术等可以用论文形式发表的，都不能用专利来保护。这是内容的差别。还有法律意义上的差别，专利实际上是专利权的简称，它是国家或地区给与专利权人的一种排他权，除非专利权人允许，他人不得实施同样的专利技术，法律强制性很强，但是论文则完全没有这种法律约束，你发表了论文，却不能影响别人实施你论文的技术（当然，侵犯著作权则是另外的事）很多搞科研的人，很重视论文的发表，觉得那是体现学识优势的途径，但是不曾想，却也是免费教材。而且很多专家习惯先发表论文，然后再去考虑申请专利，却会因为论文的公开导致丧失新颖性。
