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这个还真没试过。理论上是不行的。在我们这边,毕业的时间都是在答辩以后。所以不存在同时进行的问题。 
要所有课程都通过后(当然也包括论文和实践课)才能申请毕业的。
江苏自考本科论文报名时间:论文申请一年2次。上半年:5月25日—31日;下半年12月1日—7日;江苏自考本科论文答辩时间: 上半年5月25日—31日进行的自考本科论文申请,将于当年的11月中旬去主考院校参加论文答辩,自考本科论文成绩于12月1日前公布,12月1日—5日去当地自考办办理自考本科毕业; 下半年12月1日—7日进行的自考本科论文申请,将于次年的5月上旬去主考院校参加论文答辩,自考本科论文成绩于5月25日前公布,5月25日—29日去当地自考办办理自考本科毕业;
你是哪个省的,这个各地方情况不一样的吧我本人是考的陕西省的英语自考,本科答辩和学位考试就不冲突啊建议你去当地主考院校问下!