marklli
和学校评定准则有关,不同学校有不同的要求。至于你的顾虑,我还没有听说有学校这么做。以我的学校来说,学校任第一、二作者为同一个积分,这是因为通常学生为第一作者,第二作者必然写自己的导师,比如一篇CSCD核心为150分,CSCD扩展为80分,普通的双核为20分,等等。我不明白你的论文第二作者为什么不写自己导师呢? 
评职称的论文作者都需要评职称本人是第一作者,大学毕业论文就看大学的规定了,有的学校会承认第二作者,当然,是在第一作者是指导老师的情况下。
第一作者当然不用多说了;而通讯作者一般指整个课题的负责人。以前国内一般注重排名,老板要排在第2,现在有变化了,所谓和国际接轨哦,投国外杂志时老板可放在最后,并注名是通讯作者。当然有些老板还是看中排名的,最好要和他商量一下。
通讯作者一般指自己的指导老师,第一作者肯定是你自己,第二作者,和第三作者可以写参与多的人提议可以把外单位导师写为第二作者。第三作者和通讯作者写校内导师。但让看情况定吧,哪个好说话给那个人商量一下。
那要看你们学校毕业要求是不是导师必须是第一作者,如果是的话,你这样就白费力气,达不到毕业要求,如果都可以的话可以跟导师商量一下。