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这个你要结合你所学的知识点和结合你熟悉的方向去选择最好。最好多选几个，然后选个自己最合适的。范围能缩小就缩小。浅析质量管理在船舶涂装工程中的应用计算机在船舶结构工程中的应用浅谈船舶修理工程节能环保现状与对策船舶大修工程项目中的计量支付工作分析船舶工程虚拟现实应用平台设计研究加强流体力学技术研究引领船舶海洋工程创新高职院校船舶工程行业英语教学改革的实践船舶修理工程节能环保现状与对策研究对高职院校船舶工程专业学生管理技能培养的探讨结合船舶工程建设需求探讨我国自主CAE软件产业建设航道工程船舶机务维修与安全管理常用耐磨材料在工程船舶的应用与探讨基于物流仿真的工程船舶建造系统优化研究新形势下加强工程船舶党建工作的思考工程船舶动力机械系列化监测系统的设计海洋工程船舶电气系统和设备的现状及展望工程船舶安全管理对策探讨工程船舶液压设备故障分析浅谈工程船舶及其他机务管理特点研究试论乌江航运建设工程船舶设计与应用岷江航道整治工程船舶事故溢油预测和分析 
硕士生的论文题目多是从实际的工程问题而来。可能是一个数据采集加控制系统，伴随着EMC的问题。而这些问题的解决往往有软件算法来完成。所以你选择题目的出发点是看看导师在从事哪方面的科研课题，以及这些课题的经费支持情况。在实际问题中找题目来做。并通过在论文过程中，培养自己的科研能力（查找资料、理论分析、实验动手、论文表述），再其次在专业领域提高自己的水平（比如单片机软件编程、FPGA应用等）。
