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研究目的不同：基础研究是弄清基本的概念基本的方法，应用研究是弄清具体的问题如何为具体对象服务。 
培养方向不同1、全日制学术型硕士教育以培养教学和科研人才为主，授予学位的类型主要是学术型学位。2、专业硕士是具有职业背景的硕士学位，为培养特定职业高层次专门人才而设置。招生条件不同1、全日制学术型硕士则不需要报考者有一定年限的工作经历。2、专业硕士要求报考者有一定年限的工作经历，绝大多数专业硕士还要求在职人员报考需经所在单位或相应管理部门的同意，有的甚至要求所在单位推荐等。主要准则：基础研究是为了认识现象，获取关于现象和事实的基本原理的知识，而不考虑其直接的应用，应用研究在获得知识的过程中具有特定的应用目的。
论文题目理论研究和应用研究个人认为是论文题目的应用研究比较困难，因为应用研究是涉及到实践方面，实践方面的话就要需要开展其他的活动，也就是说不仅仅是在纸面上的活动，可能要进行各种实验，或者是各种走访以及采访。所以在论文题目里面理论研究应该是会比应用研究简单的，理论研究的话可能就是写论文，在写论文之前要先写开题报告并且答辩这样子的一个操作就是理论研究的一个过程。理论研究仅涉及到纸面上的研究也就是参考各种文献去写一篇论文，这样子所以个人认为论文题目的理论研究是会比应用研究要简单的。
应用理论研究是理论研究，理论研究和应用研究就有区别了。无所谓哪个论文好些，关键你擅长写哪种，即你拥有的资源方便写哪个。如果“一穷二白”，那还是应用研究吧。理论研究要求的“功底”更深。
